برنامج Genomics LIMS

برنامج Genomics LIMS وNGS Lab لسير عمل تسلسل الجيل التالي

LIMS الجينومية المصممة لهذا الغرض لمختبرات NGS، وإدارة سير العمل بدءًا من أخذ العينة وحتى تسليم التسلسل مع تكامل التسلسل، وإمكانية التتبع الكاملة ودعم سير العمل المتوافق مع ISO/IEC 17025.

تم تكوين NGS LIMS حول حالات العينة والمكتبة والتشغيل والتحليل

Genomics LIMS ربط الخدمات اللوجستية والتحليلات ومراقبة الجودة والمخزون والإحصائيات

كيانات الجينوم الأساسية

  • العينات وأنواع العينات
  • دفعات التضخيم
  • استخراج الحمض النووي/الحمض النووي الريبي (RNA).
  • تحضيرات المكتبة
  • فحوصات PCR و qPCR
  • قياسات مراقبة الجودة بالمكتبة
  • تعيينات الفهرس
  • تخطيطات اللوحة
  • قطع التمهيدي والمسبار
  • نتائج ط م
  • المكتبات المجمعة
  • تقدير كمية البركة
  • تشغيل التسلسل
  • تعيينات المسار
  • نتائج التحكم
  • قراءة الهياكل
  • عينات منزوعة الإرسال
  • تتبع ملف Fastq
  • تشغيل خط أنابيب التحليل
  • نقاط مراقبة الجودة
  • المشاريع والدراسات
  • تسليمات العملاء
  • تتبع دفعة الكاشف
  • مجموعات الفهرس والرموز الشريطية
  • أدوات التسلسل
  • مواقع التخزين

التكامل

  • أنظمة Illumina NovaSeq
  • منصات Illumina NextSeq
  • أدوات Illumina MiSeq
  • أكسفورد نانوبور مينيون
  • أكسفورد نانوبور بروميثيون
  • أنظمة القياس الكمي qPCR
  • أدوات PCR في الوقت الحقيقي
  • أنظمة استخلاص الحمض النووي
  • معالجات السوائل
  • تكامل المحلل الحيوي
  • استيراد بيانات TapeStation
  • نتائج محلل الأجزاء
  • قياسات مقياس التألق الكمي
  • قارئات اللوحة
  • الدراجات الحرارية
  • خطوط أنابيب LIMS إلى المعلوماتية الحيوية
  • توليد ورقة العينة
  • استيراد demux CSV الآلي
  • تكامل BaseSpace
  • اتصالات API المخصصة
  • أنظمة التشغيل الآلي للمختبرات
  • ماسحات الباركود

الامتثال

  • دعم سير العمل المتوافق مع ISO/IEC 17025
  • مسارات التدقيق الكاملة
  • تتبع سلسلة الحضانة
  • نموذج تتبع النسب
  • التحكم في الإصدار
  • ضوابط وصول المستخدم
  • الأذونات المستندة إلى الدور
  • التوقيعات الإلكترونية
  • سجلات معايرة الأجهزة
  • سجلات صيانة المعدات
  • وثائق التحقق من صحة الطريقة
  • إجراءات التشغيل القياسية
  • تكامل إدارة الجودة
  • تتبع عدم المطابقة
  • سجلات الإجراءات التصحيحية
  • التقارير التنظيمية
  • ضوابط سلامة البيانات
  • إدارة سجلات الدُفعات
  • سجلات إصدار دفعة الكاشف
  • إدارة الوثائق
  • سجلات التدريب
  • سجلات التحقق من الطريقة

تغطي هذه ما تقوم بتكوينه معظم مختبرات التسلسل والجزيئات. تتم إضافة أي شيء خاص بفحوصاتك أو منصاتك أو نطاق الاعتماد أثناء الإعداد.

ميزات برنامج Genomics LIMS لمختبرات التسلسل من الجيل التالي

القدرات المبنية لكيفية تشغيل مختبرات التسلسل والجزيئات فعليًا، بدءًا من التقاط تصادمات الفهرس قبل إنشاء التجمع وحتى حجب النتيجة عند فشل عنصر التحكم.

Odoo

نظام LIMS للجينوميات مبني على Odoo

يعتمد Lims.science بالكامل على Odoo، وهو نظام ERP قوي يثق به أكثر من 15 مليون مستخدم في جميع أنحاء العالم.

لقد قمنا بتكييفه خصيصًا لمختبرات التسلسل من الجيل التالي. يمكنك إدارة كل شيء بدءًا من تتبع العينات وإعداد المكتبة وحتى تشغيل التسلسل وإزالة تعدد الإرسال والامتثال في مكان واحد.

هل تحتاج إلى مساعدة؟

الأسئلة الشائعة

يقوم نظام LIMS لعلم الجينوم بتتبع المسار الذي تسلكه العينة عبر معمل التسلسل. الاستلام والانضمام، واستخراج الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي (RNA)، وإعداد المكتبة، وتعيين الفهرس، والتجميع، والتشغيل نفسه، ثم إزالة تعدد الإرسال وتسليم ملفات FASTQ. فهو يحمل قياس مراقبة الجودة الذي تم إجراؤه عند كل عملية تسليم ويحافظ على أن تراه هيئات اعتماد مسار التدقيق. عادةً ما تقوم المختبرات التي لا تحتوي على واحد بإجراء ذلك عبر جداول البيانات وأوراق العينات التي لا تتوافق مع ما فعلته الأداة بالفعل.

يمكن تكوين نظام إدارة معلومات الجينوم لدعم المتطلبات ذات الصلة بنطاق ISO/IEC 17025 الخاص بالمختبر. يتم تحديد تواريخ التغيير المنسوبة والمختومة زمنيًا، والموافقة الإلكترونية أو ضوابط التوقيع، وسجلات الأدوات، ووثائق التحقق من صحة الطريقة، والسجلات الخاضعة للرقابة والتحقق من صحتها للاستخدام المقصود.

نعم. نحن ندعم التكامل مع منصات Illumina (NovaSeq وNextSeq وMiSeq) وأنظمة Oxford Nanopore وأدوات مراقبة الجودة الشائعة بما في ذلك Bioanalyzer وTapeStation وأنظمة qPCR وQubit. يمكن تكوين النظام ليناسب أسطول الأدوات الخاص بك ومتطلبات سير العمل.

يتحقق النظام من توافق الفهرس عند إنشاء مكتبات مجمعة، والتحقق من التعارضات المحتملة بناءً على مجموعات الفهرس وكيمياء التسلسل. يمكنك الاحتفاظ بمكتبات شاملة للمجموعات المفهرسة المزدوجة مع التحقق التلقائي من الصحة لحماية عمليات التسلسل الباهظة الثمن من فشل تضارب الفهرس.

نعم. يتم تكوين بروتوكولات إعداد المكتبة ونقاط تفتيش مراقبة الجودة ومعلمات تشغيل التسلسل والأدوار وبوابات الموافقة حول العملية المعتمدة للمختبر. يمكن التحكم في التغييرات في الإصدار وتاريخ سريانها أثناء التنفيذ والتحكم المستمر في التغيير.

الجينوم الكامل، والإكسوم، والألواح المستهدفة، والأمبليكون، وتسلسل الحمض النووي الريبي (RNA-seq) والميتاجينوميات، مع أنواع العينات من الدم والأنسجة وحتى المسحات ومصفوفات التربة والغذاء. يتم التعامل مع العمل الجزيئي الذي يتوقف عن التسلسل بنفس الطريقة. يعمل كل من qPCR ونقطة النهاية PCR كسير عمل خاص بهما، مع 96 و384 تخطيطًا للوحة البئر، والتقاط Ct لكل بئر، وتتبع دفعات الاستخراج إلى مجموعة الأدوات المستخدمة. يتم تكوين تعريفات الفحص التي تغطي الأهداف ومعلمات التدوير ومعايير القبول مرة واحدة ويتم تطبيقها على كل عملية تشغيل بعد ذلك.

توجد خيارات مجانية ومفتوحة المصدر، ويمكن أن تكون كافية بالنسبة لمختبر صغير يتتبع مجموعة من العينات. حيث ينفد عادةً تكامل جهاز التسلسل، والتحقق من صحة تضارب الفهرس، وإمكانية تتبع كمية الكاشف، وسجلات التدقيق التي يتوقع المقيِّم رؤيتها. تميل المختبرات إلى البدء في النظر مرة أخرى إلى النقطة التي يصبح فيها الاعتماد حقيقيًا.

نحن نسعر أقل بكثير من منصات المؤسسة التي تحصل عليها معظم مختبرات علم الجينوم، ونقيس التكلفة مع فريقك وحجم المختبر بدلاً من حجم الاختبار. انظر صفحة التسعير للأرقام الحالية.

يمكنك استيراد نتائج إزالة تعدد الإرسال عبر تحميل ملف CSV أو التكامل مباشرة مع خط أنابيب المعلوماتية الحيوية الخاص بك. يقوم النظام بربط العينات التي تمت إزالة تعدد إرسالها مرة أخرى بمكتباتها المصدرية وتشغيل التسلسل، مما يحافظ على إمكانية التتبع الكاملة بدءًا من استلام العينة وحتى تسليم البيانات النهائية.

ابدأ في إدارة التسلسل وسير العمل الجزيئي في نظام واحد

قم بمراجعة نظام LIMS الذي تم تكوينه لسير عمل NGS الخاص بك، بدءًا من الانضمام والاستخراج وحتى إعداد المكتبة والتجميع والتسلسل ومراجعة مراقبة الجودة وتسليم البيانات.

Scroll to Top