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LIMS genomico per laboratori NGS

LIMS genomico per laboratori NGS

LIMS genomico su Odoo che collega analitica, metrologia, controllo qualità, controlli normativi, inventario, logistica e statistica. Flussi autorizzati e sottoposti a controllo di versione configurano stati di campione, libreria, pool, corsa e analisi per sostenere ISO/IEC 17025 o ISO 15189 nel campo applicabile.

LIMS NGS configurato attorno agli stati di campione, libreria, corsa e analisi

Il settore in pratica · Genomica

Due viste del flusso di laboratorio

Interfaccia illustrativa · dati fittizi

Identità delle librerie, resa e qualità delle letture restano collegate nella revisione, senza dati genomici personali.

Esempi generali presentati a scopo illustrativo.

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Progettato per la complessità della genomica

Capacità di integrazione

  • Sistemi Illumina NovaSeq
  • Piattaforme Illumina NextSeq
  • Strumenti Illumina MiSeq
  • Oxford Nanopore MinION
  • Oxford Nanopore PromethION
  • Sistemi di quantificazione qPCR
  • Integrazione Bioanalyzer
  • Importazione dati TapeStation
  • Risultati Fragment Analyzer
  • Misurazioni fluorimetro Qubit
  • Lettori di piastre
  • Termociclatori
  • Pipeline LIMS-bioinformatica
  • Generazione fogli campione
  • Importazione CSV demux automatizzata
  • Integrazione BaseSpace
  • Connessioni API personalizzate
  • Sistemi di automazione di laboratorio
  • Scanner di codici a barre

Entità genomiche fondamentali

  • Campioni e tipi di campioni
  • Estrazione di DNA/RNA
  • Preparazione delle librerie
  • Misurazioni QC delle librerie
  • Assegnazione degli indici
  • Librerie aggregate
  • Quantificazione delle aggregazioni
  • Esecuzioni di sequenziamento
  • Assegnazione delle corsie
  • Strutture di lettura
  • Campioni demultiplexati
  • Tracciatemento dei file Fastq
  • Esecuzioni della pipeline di analisi
  • Punti di controllo della qualità
  • Progetti e studi
  • Risultati finali per i clienti
  • Tracciatemento dei lotti di reagenti
  • Set di indici e codici a barre
  • Strumenti di sequenziamento
  • Luoghi di conservazione

Conformità e tracciabilità

  • Controlli configurabili a supporto di ISO/IEC 17025 e ISO 15189
  • Registrazioni di audit configurabili
  • Tracciabilità della catena di custodia
  • Tracciabilità dei campioni
  • Controllo delle versioni
  • Controlli di accesso
  • Autorizzazioni per ruolo
  • Firme elettroniche (ALCOA+)
  • Registri di taratura
  • Registri di manutenzione
  • Validazione dei metodi
  • Procedure operative (SOP)
  • Gestione qualità integrata
  • Gestione del lavoro non conforme
  • Azioni correttive e preventive (CAPA)
  • Reportistica per audit
  • Integrità e sicurezza dei dati
  • Gestione lotti e reagenti
  • Gestione documentale
  • Registri di formazione del personale

Caratteristiche principali per laboratori NGS

Funzionalità appositamente progettate per affrontare la complessità unica dei flussi di lavoro genomici, dalla prevenzione dei conflitti di indice alla garanzia della conformità normativa.

Tracciabilità completa dei campioni

Tracciate l’intero percorso del campione, dalla libreria al pooling, al sequenziamento e alla consegna dei dati.

Prevenire costosi conflitti di indici

La convalida integrata rileva collisioni di indici prima del pooling, evitando errori e sequenze costose fallite.

Integrazione e Connettività

Si sincronizza con Illumina, Oxford Nanopore e strumenti QC, oltre a SAP, Microsoft Dynamics, JD Edwards, Oracle, Salesforce e altre piattaforme tramite i connettori aperti di Odoo.

Generazione automatica dei fogli campione

Genera fogli campione convalidati e privi di errori, con indici, corsie e parametri di esecuzione corretti.

Gestione centralizzata del controllo qualità

Consolida i controlli qualità di libreria, pool ed esecuzione in un unico sistema con criteri configurabili.

Supporto ai requisiti ISO/IEC 17025 e ISO 15189 applicabili

Audit trail, firme elettroniche e documentazione controllata possono sostenere requisiti applicabili, subordinatamente al campo, alle procedure e alla configurazione convalidata del laboratorio.

Odoo Official Partner

Sistema di gestione del laboratorio di genomica basato su Odoo

Lims.science funziona interamente su Odoo, un potente sistema ERP utilizzato da oltre 15 milioni di utenti in tutto il mondo.

Lo abbiamo adattato specificamente per i laboratori di sequenziamento di nuova generazione. È possibile gestire tutto, dal tracciamento dei campioni e la preparazione delle librerie alle operazioni di sequenziamento, demultiplexing e conformità in un unico posto.

  • Configura protocolli, set di indici e soglie QC per i tuoi flussi NGS.
  • Tracciate i campioni dalla libreria al pooling, al sequenziamento e al demultiplexing con tracciabilità completa.
  • Approva o rifiuta i risultati con audit trail completi, includendo QC, convalida dell’esecuzione e flag di qualità.
  • Assegna l’accesso in base al ruolo, così tecnici, bioinformatici, QA e clienti vedono solo ciò che serve.
  • Centralizza le operazioni di sequenziamento multisito in un’unica dashboard per ricerca, clinica e servizi.
  • Accedete via cloud o installa sul tuo server. Requisiti e configurazione definiti in fase di implementazione.

Hai bisogno di aiuto?

Domande frequenti

Il LIMS genomico può supportare i requisiti applicabili mediante registrazioni di audit configurate, firme elettroniche, stato di taratura e registrazioni di riferibilità metrologica, documentazione di validazione o verifica dei metodi e flussi di qualità. Conserva separatamente la catena di custodia dei campioni e le evidenze documentali definite dal laboratorio.

Sì. Supportiamo l’integrazione con le piattaforme Illumina (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), i sistemi Oxford Nanopore e gli strumenti di controllo qualità più comuni, tra cui Bioanalyzer, TapeStation, sistemi qPCR e Qubit. Il sistema può essere configurato in base alle specifiche esigenze della vostra flotta di strumenti e del vostro flusso di lavoro.

Il sistema verifica la compatibilità degli indici durante la creazione di librerie condivise, controllando eventuali conflitti in base ai set di indici e alla chimica di sequenziamento. È possibile gestire librerie complete di combinazioni con doppio indice grazie alla convalida automatica, proteggendo così costose operazioni di sequenziamento da errori dovuti a conflitti tra indici.
Assolutamente sì. Basato sul framework flessibile di Odoo, è possibile configurare protocolli di preparazione delle librerie, punti di controllo QC, parametri di sequenziamento e flussi di lavoro di approvazione in modo da adattarli ai processi specifici del proprio laboratorio. È inoltre possibile esportare report e risultati su altri software o piattaforme ERP senza formattazione manuale. Collaboriamo con voi durante l’implementazione per adattare il sistema alle vostre esigenze.

Il sistema gestisce diversi tipi di campioni (tessuti, sangue, saliva, campioni ambientali) e applicazioni di sequenziamento, tra cui sequenziamento dell’intero genoma (WGS), sequenziamento dell’intero esoma (WES), RNA-seq, pannelli mirati, metagenomica e sequenziamento di singole cellule. I flussi di lavoro sono personalizzabili per operazioni di sequenziamento a fini di ricerca, clinici e commerciali.

È possibile importare i risultati del demultiplexing tramite caricamento CSV o integrarli direttamente nella propria pipeline bioinformatica. Il sistema ricollega i campioni demultiplexati alle loro librerie di origine e alle sequenze di sequenziamento, mantenendo la completa tracciabilità dal ricevimento del campione alla consegna dei dati finali.

Gestisci il tuo sequenziamento con un LIMS dedicato

Scoprite come un LIMS dedicato può governare i flussi NGS, dal campione alla consegna autorizzata dei dati. Richiedete una demo personalizzata.

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