LIMS de Genómica y Genética para Laboratorios de Secuenciación NGS
LIMS de NGS configurado según estados de muestra, biblioteca, secuenciación y análisis
El sector en la práctica · Genómica
Dos vistas del flujo de su laboratorio
La identidad de las bibliotecas, el rendimiento y la calidad de lecturas permanecen conectados durante la revisión, sin datos genómicos personales.
Ejemplos generales presentados a título ilustrativo.
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Genómica: logística, análisis y gestión de resultados, control de calidad, inventario y estadística conectados
Entidades genómicas fundamentales
- Muestras y tipos de muestras
- Extracciones de ADN/ARN
- Preparación de bibliotecas
- Mediciones de control de calidad de bibliotecas
- Asignaciones de índices
- Bibliotecas agrupadas
- Cuantificación de agrupaciones
- Lotes de cebadores y sondas
- Ejecuciones de secuenciación
- Asignaciones de carriles
- Estructuras de lectura
- Muestras demultiplexadas
- Seguimiento de archivos Fastq
- Valores de Ct
- Ejecuciones de procesos de análisis
- Mapas de placas
- Puntos de control de calidad
- Proyectos y estudios
- Entregables para clientes
- Seguimiento de lotes de reactivos
- Lotes de amplificación
- Conjuntos de índices y códigos de barras
- Ensayos de PCR y qPCR
- Metrología de secuenciación
- Resultados de controles
- Ubicaciones de almacenamiento
Capacidades de integración
- Sistemas Illumina NovaSeq.
- Plataformas Illumina NextSeq.
- Metrología Illumina MiSeq.
- Oxford Nanopore MinION.
- Oxford Nanopore PromethION.
- Sistemas de cuantificación qPCR.
- Inventario y operaciones en Odoo con Bioanalyzer.
- Importación de datos TapeStation
- Estaciones de pipeteo automatizado
- Resultados del Fragment Analyzer
- Mediciones del fluorímetro Qubit
- Lectores de placas
- Termocicladores
- Canales de LIMS a bioinformática
- Generación de hojas de muestras
- Sistemas de extracción de ácidos nucleicos
- Importación CSV demux automatizada
- Inventario y operaciones en Odoo BaseSpace
- Conexiones API personalizadas
- Sistemas de automatización de laboratorios
- Escáneres de códigos de barras
- Metrología de PCR en tiempo real
Cumplimiento y trazabilidad
- Apoyo a requisitos aplicables de ISO/IEC 17025
- Requisitos del organismo de acreditación aplicable, cuando correspondan al alcance del laboratorio
- Registros configurados para apoyar el alcance acreditado del laboratorio, cuando corresponda
- Requisitos EMA (México)
- Normas OAA (Argentina)
- Historiales de cambios atribuibles y con fecha y hora
- Cadena de custodia
- Linaje de muestras
- Control de versiones
- Controles de acceso de usuarios
- Permisos basados en roles
- Firmas electrónicas
- Calibración de instrumentos
- Mantenimiento de equipos
- Validación de métodos
- Procedimientos operativos estándar
- Registros de liberación de lotes de reactivos
- Gestión de calidad
- Control del trabajo no conforme y seguimiento de no conformidades relacionadas
- Acciones correctivas
- Informes reglamentarios
- Integridad de datos
- Gestión de documentos
- Registros de formación
- Registros de verificación de métodos
Estos elementos cubren lo que configura la mayoría de los laboratorios moleculares y de secuenciación. Todo lo específico de sus ensayos, plataformas o alcance de acreditación se añade durante la configuración.
Características Clave del LIMS de Genética y Genómica para Laboratorios NGS
Funcionalidades específicas que abordan la complejidad única de los flujos de trabajo genómicos, desde la prevención de conflictos de índices hasta el cumplimiento normativo.
Trazabilidad documentada de las muestras
Registre el linaje desde el espécimen original hasta la entrega de datos mediante los eventos y documentos definidos en el flujo configurado.
Evite costosos conflictos de índices
La validación integrada detecta posibles colisiones de índices antes de crear el pool, protegiendo corridas de secuenciación costosas de un fallo.
Inventario y operaciones en Odoo y Conectividad
Sincroniza con Illumina, Oxford Nanopore e instrumentos de QC, así como con SAP, Microsoft Dynamics, JD Edwards, Oracle, Salesforce y otras plataformas mediante integraciones con alcance, mapeo, validación y tratamiento de excepciones definidos durante la implantación.
Generación automatizada de hojas de muestras
Consolide los puntos de QC, desde biblioteca y pool hasta valores de Ct, en un sistema con criterios configurables de aprobación y rechazo.
Gestión centralizada del control de calidad
Consolide todos los puntos de QC (biblioteca, pool y métricas de corrida) en un sistema con criterios configurables de aprobación/rechazo.
Apoyo a requisitos aplicables de ISO/IEC 17025
Los historiales de cambios atribuibles, las firmas electrónicas y la documentación controlada pueden apoyar los requisitos que el laboratorio determine como aplicables. Su suficiencia debe verificarse dentro del sistema de gestión y de la implantación validada.
Sistema de gestión de laboratorios genómicos basado en Odoo
Lims.science funciona íntegramente con Odoo, un potente sistema ERP en el que confían más de 28 millones de usuarios en todo el mundo.
Lo hemos adaptado específicamente para los laboratorios de secuenciación de última generación. Podrá gestionar todo, desde el seguimiento de muestras y la preparación de bibliotecas hasta las secuenciaciones, la demultiplexación y el cumplimiento normativo, en un solo lugar.
- Configure protocolos NGS, conjuntos de índices y umbrales de QC para sus flujos de trabajo.
- Seguimiento documentado desde la preparación de la biblioteca hasta la demultiplexación mediante los eventos definidos en el flujo.
- Aprobación o rechazo de resultados con historial atribuible de revisión del control de calidad, validación de corridas e indicadores definidos.
- Control de acceso por rol: técnicos, bioinformáticos, gerentes de QC y clientes ven solo lo relevante.
- Centralice operaciones multi-sitio de investigación o comerciales en un solo panel de control.
- Acceda desde cualquier lugar a través de la nube o instálelo en su propio servidor seguro.
¿Necesitas ayuda?
Preguntas frecuentes
¿Cómo puede el LIMS apoyar los requisitos de calidad y acreditación aplicables a un laboratorio de secuenciación?
El LIMS puede apoyar historiales de cambios atribuibles, firmas electrónicas, registros de calibración, validación de métodos, cadena de custodia y flujos de calidad. El laboratorio debe determinar qué norma y requisitos son aplicables a su actividad y alcance; el LIMS no confiere acreditación ni conformidad por sí mismo.
¿El sistema puede manejar múltiples plataformas e instrumentos de secuenciación?
Sí. Admitimos la integración con plataformas Illumina (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), sistemas Oxford Nanopore e instrumentos comunes de control de calidad, incluidos Bioanalyzer, TapeStation, sistemas qPCR y Qubit. El sistema se puede configurar para adaptarse a su flota de instrumentos específica y a los requisitos de su flujo de trabajo.
¿Cómo evita el LIMS los conflictos de índices en las ejecuciones multiplexadas?
El sistema valida la compatibilidad de los índices al crear bibliotecas agrupadas, comprobando posibles conflictos basándose en sus conjuntos de índices y la química de secuenciación. Puede mantener bibliotecas completas de combinaciones con doble índice con validación automática para proteger las costosas secuenciaciones de fallos por colisión de índices.
¿Podemos personalizar los flujos de trabajo para nuestros protocolos de secuenciación específicos?
¿Qué tipos de muestras y aplicaciones de secuenciación son compatibles?
¿Cómo se introducen los datos demultiplexados en el LIMS?
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