Software Genomics LIMS e NGS Lab para fluxos de trabalho de sequenciamento de última geração
LIMS genômico desenvolvido especificamente para laboratórios NGS, gerenciando fluxos de trabalho desde a ingestão de amostras até a entrega de sequências com integrações de sequenciamento, rastreabilidade total e suporte para fluxos de trabalho alinhados à ISO/IEC 17025.
NGS LIMS configurado em torno dos estados de amostra, biblioteca, execução e análise
O setor na prática · Genômica
Duas visualizações do fluxo do seu laboratório
Identidade da biblioteca, rendimento do sequenciamento e métricas de qualidade das leituras permanecem conectados na revisão técnica, sem dados genômicos pessoais.
Exemplos gerais apresentados para fins ilustrativos.
Clique em uma visualização para ampliá-la.
Genomics LIMS Conectando Logística, Análise, Controle de Qualidade, Inventário e Estatística
Entidades Centrais de Genômica
- Amostras e tipos de amostras
- Lotes de amplificação
- Extrações de DNA/RNA
- Preparativos da biblioteca
- Ensaios PCR e qPCR
- Medições de CQ da biblioteca
- Atribuições de índice
- Layouts de placas
- Lotes de primer e sonda
- Resultados de CT
- Bibliotecas agrupadas
- Quantificação do pool
- Execuções de sequenciamento
- Atribuições de pista
- Resultados de controle
- Ler estruturas
- Amostras demultiplexadas
- Rastreamento de arquivo Fastq
- Execuções do pipeline de análise
- Pontos de verificação de controle de qualidade
- Projetos e estudos
- Entregas do cliente
- Rastreamento de lote de reagentes
- Conjuntos de índices e códigos de barras
- Instrumentos de sequenciamento
- Locais de armazenamento
Integração
- Sistemas Illumina NovaSeq
- Plataformas Illumina NextSeq
- Instrumentos Illumina MiSeq
- Oxford Nanopore MinION
- Oxford Nanopore PromethION
- Sistemas de quantificação qPCR
- Instrumentos de PCR em tempo real
- Sistemas de extração de ácido nucleico
- Manipuladores de líquidos
- Integração do bioanalisador
- Importação de dados do TapeStation
- Resultados do analisador de fragmentos
- Medições do fluorômetro Qubit
- Leitores de placas
- Termocicladores
- Pipelines de LIMS para bioinformática
- Geração de planilha de amostra
- Importação automatizada de demux CSV
- Integração BaseSpace
- Conexões API personalizadas
- Sistemas de automação laboratorial
- Leitores de código de barras
Conformidade
- Suporte para fluxos de trabalho alinhados à ISO/IEC 17025
- Trilhas de auditoria completas
- Rastreamento da cadeia de custódia
- Exemplo de rastreamento de linhagem
- Controle de versão
- Controles de acesso do usuário
- Permissões baseadas em funções
- Assinaturas eletrônicas
- Registros de calibração do instrumento
- Registros de manutenção de equipamentos
- Documentação de validação de método
- Procedimentos operacionais padrão
- Integração de gestão de qualidade
- Rastreamento de não conformidades
- Registros de ações corretivas
- Relatórios regulatórios
- Controles de integridade de dados
- Gerenciamento de registros em lote
- Registros de liberação de lote de reagentes
- Gerenciamento de documentos
- Registros de treinamento
- Registros de verificação de método
Eles cobrem o que a maioria dos laboratórios moleculares e de sequenciamento configuram. Qualquer coisa específica para seus ensaios, plataformas ou escopo de acreditação é adicionada durante a configuração.
Recursos do software Genomics LIMS para laboratórios de sequenciamento de última geração
Recursos desenvolvidos para o funcionamento real dos laboratórios moleculares e de sequenciamento, desde a captura de colisões de índice antes que um pool seja criado até a retenção de um resultado quando um controle falha.

LIMS de genômica baseado em Odoo
O Lims.science é totalmente baseado em Odoo, um sistema ERP robusto utilizado por mais de 15 milhões de usuários em todo o mundo.
Nós o adaptamos especificamente para laboratórios de sequenciamento de próxima geração. Você pode gerenciar tudo, desde rastreamento de amostras e preparação de biblioteca até execuções de sequenciamento, demultiplexação e conformidade em um só lugar.
- Configure protocolos de sequenciamento, conjuntos de índices e limites de controle de qualidade para seus fluxos de trabalho NGS específicos
- Rastreie amostras por meio de preparação de biblioteca, pooling, execuções de sequenciamento e demultiplexação com rastreabilidade completa
- Aprovar ou rejeitar resultados com históricos de alterações atribuíveis e com registro de data e hora, cobrindo verificações de CQ configuradas, revisão de execução e sinalizadores de qualidade
- Atribua acesso de usuário por função para que técnicos de laboratório, bioinformáticos, gerentes de controle de qualidade e clientes vejam apenas o que precisam
- Centralize operações em vários locais em instalações de pesquisa, laboratórios de testes moleculares ou provedores de serviços de sequenciamento em um único painel
- Acesse em qualquer lugar através da nuvem ou instale em seu próprio servidor seguro
Precisa de ajuda?
Perguntas frequentes
O que é um LIMS em genômica?
Um LIMS genômico rastreia o caminho que uma amostra percorre em um laboratório de sequenciamento. Recebimento e acesso, extração de DNA ou RNA, preparação de biblioteca, atribuição de índice, pooling, execução em si, demultiplexação e entrega de arquivos FASTQ. Ele mantém a medição de CQ realizada em cada transferência e mantém a trilha de auditoria que os organismos de acreditação solicitam. Laboratórios sem um geralmente executam isso em planilhas e folhas de amostra que ficam fora de sintonia com o que o instrumento realmente fez.
Como este LIMS suporta a ISO/IEC 17025 para laboratórios de sequenciamento?
O LIMS genômico pode ser configurado para suportar requisitos relevantes ao escopo ISO/IEC 17025 do laboratório. Históricos de alterações atribuíveis e com registro de data e hora, aprovação eletrônica ou controles de assinatura, registros de instrumentos, documentação de validação de métodos e registros controlados são especificados e validados para o uso pretendido.
O sistema pode lidar com múltiplas plataformas e instrumentos de sequenciamento?
Sim. Apoiamos a integração com plataformas Illumina (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), sistemas Oxford Nanopore e instrumentos de controle de qualidade comuns, incluindo Bioanalyzer, TapeStation, sistemas qPCR e Qubit. O sistema pode ser configurado para sua frota de instrumentos e requisitos de fluxo de trabalho específicos.
Como o LIMS evita conflitos de índice em execuções multiplexadas?
O sistema valida a compatibilidade do índice ao criar bibliotecas agrupadas, verificando possíveis conflitos com base nos seus conjuntos de índices e na química do sequenciamento. Você pode manter bibliotecas abrangentes de combinações indexadas duplas com validação automática para proteger execuções dispendiosas de sequenciamento contra falhas de colisão de índice.
Podemos personalizar fluxos de trabalho para nossos protocolos de sequenciamento específicos?
Sim. Protocolos de preparação de biblioteca, pontos de verificação de CQ, parâmetros de execução de sequenciamento, funções e portas de aprovação são configurados em torno do processo autorizado do laboratório. As alterações podem ser controladas por versão e datadas de vigência durante a implementação e o controle contínuo das alterações.
Quais tipos de amostras e aplicações de sequenciamento são suportadas?
Genoma completo, exoma, painéis direcionados, amplicon, RNA-seq e metagenômica, com tipos de amostras de sangue e tecido até esfregaços, solo e matrizes alimentares. O trabalho molecular que pára antes do sequenciamento é tratado da mesma maneira. qPCR e PCR de endpoint são executados como seus próprios fluxos de trabalho, com layouts de placas de 96 e 384 poços, captura de Ct por poço e lotes de extração rastreados até o lote do kit usado. As definições de ensaio que abrangem alvos, parâmetros de ciclo e critérios de aceitação são configuradas uma vez e aplicadas a cada execução posterior.
Existe um LIMS de genômica gratuito e quanto custa o seu?
Existem opções gratuitas e de código aberto e, para um pequeno laboratório que rastreia um punhado de amostras, elas podem ser suficientes. Eles geralmente se esgotam na integração do sequenciador, na validação de conflitos de índice, na rastreabilidade do lote de reagentes e nos registros de auditoria que um avaliador espera ver. Os laboratórios tendem a começar a olhar novamente no momento em que o credenciamento se torna real.
Temos preços bem abaixo das plataformas empresariais cotadas pela maioria dos laboratórios de genômica, e os custos variam de acordo com o tamanho da sua equipe e do laboratório, e não com o volume de testes. Veja o página de preços para números atuais.
Como os dados demultiplexados entram no LIMS?
Você pode importar resultados de demultiplexação via upload CSV ou integrar diretamente com seu pipeline de bioinformática. O sistema vincula amostras demultiplexadas de volta às suas bibliotecas de origem e execuções de sequenciamento, mantendo a rastreabilidade completa desde o recebimento da amostra até a entrega final dos dados.
Comece a gerenciar seus fluxos de trabalho moleculares e de sequenciamento em um único sistema
Revise um LIMS configurado para seu fluxo de trabalho NGS, desde o acesso e extração até a preparação da biblioteca, agrupamento, sequenciamento, revisão de CQ e entrega de dados.