Yeni Nesil Dizileme Laboratuvarları için Genomik LIMS
Genomik LIMS; analitik, metroloji, kalite kontrol, kalite ve mevzuat kontrolleri, envanter, lojistik ve istatistik alanlarını numune, ekstraksiyon, kütüphane, havuz, çalıştırma ve analiz durumları çevresinde birleştirir. Yetkilendirilmiş, sürüm kontrollü iş akışları her alanı protokol ve proje gerekliliklerine göre yapılandırır.
Numune, Kütüphane, Çalıştırma ve Analiz Durumları Çevresinde Yapılandırılmış NGS LIMS'i
Sektör uygulaması · Genomik
Laboratuvar iş akışınızdan iki görünüm
Kütüphane kimliği, dizileme verimi ve okuma kalitesi ölçümleri teknik incelemeye kadar bağlantılı kalır; kişisel genomik veri içermez.
Yalnızca gösterim amacıyla sunulan genel örnekler.
Büyütmek için bir görünüme tıklayın.
Genomik Laboratuvarlarının Karmaşıklığına Uygun Olarak Tasarlanmıştır
Temel Genomik Varlıklar
- Numuneler ve numune türleri
- DNA/RNA ekstraksiyonları
- Kütüphane hazırlıkları
- Kütüphane kalite kontrol ölçümleri
- İndeks atamaları
- Birleştirilmiş kütüphaneler
- Havuz kantifikasyonu
- Sekanslama çalıştırmaları
- Şerit atamaları
- Okuma yapıları
- Demultiplekslenmiş numuneler
- Fastq dosyası takibi
- Analiz boru hattı çalıştırmaları
- Kalite kontrol kontrol noktaları
- Projeler ve çalışmalar
- Müşteriye teslim edilecekler
- Reaktif parti takibi
- İndeks setleri ve barkodlar
- Sekanslama cihazları
- Depolama konumları
- …vb.
Entegrasyon Olanakları
- Illumina NovaSeq sistemleri
- Illumina NextSeq platformları
- Illumina MiSeq cihazları
- Oxford Nanopore MinION
- Oxford Nanopore PromethION
- qPCR kantifikasyon sistemleri
- Bioanalyzer entegrasyonu
- TapeStation veri içe aktarma
- Fragment Analyzer sonuçları
- Qubit florometre ölçümleri
- Plaka okuyucular
- Termosiklatörler
- LIMS-biyoinformatik iş akışları
- Numune sayfası oluşturma
- Otomatik demux CSV içe aktarma
- BaseSpace entegrasyonu
- Özel API bağlantıları
- Laboratuvar otomasyon sistemleri
- Barkod tarayıcılar
- …vb.
Uyumluluk ve İzlenebilirlik
- ISO/IEC 17025 kapsamındaki kontrollü süreç desteği
- ISO 15189 kapsamındaki kontrollü süreç desteği
- Yapılandırılmış ve atfedilebilir denetim kayıtları
- Gözetim zinciri takibi
- Numune geçmişi takibi
- Sürüm kontrolü
- Kullanıcı erişim kontrolleri
- Rol tabanlı izinler
- Elektronik imzalar
- Cihaz kalibrasyon kayıtları
- Ekipman bakım günlükleri
- Yöntem doğrulama belgeleri
- Standart çalışma prosedürleri
- Kalite yönetimi entegrasyonu
- Uygunsuzluk takibi
- Düzeltici eylem kayıtları
- Yasal raporlama
- Veri bütünlüğü kontrolleri
- Parti kayıt yönetimi
- Belge yönetimi
- Eğitim kayıtları
- …vb.
Yeni Nesil Dizileme Laboratuvarları için Temel Özellikler
Genomik iş akışlarının kendine özgü karmaşıklığını ele alan, indeks çakışmalarını önlemekten yasal düzenlemelere uyumu sağlamaya kadar uzanan, amaca yönelik olarak geliştirilmiş özellikler.
Odoo tabanlı genomik laboratuvar yönetim sistemi
Lims.science, dünya çapında 15 milyondan fazla kullanıcı tarafından güvenilen güçlü bir ERP sistemi olan Odoo ile tamamen uyumlu olarak çalışır.
Bu sistemi, son teknoloji sekanslama laboratuvarları için özel olarak uyarladık. Numune takibi ve kütüphane hazırlığından sekanslama, demultipleksleme ve mevzuata uygunluğa kadar her şeyi tek bir yerden yönetebilirsiniz.
- NGS akışlarınız için dizileme protokollerini, indeksleri ve kalite eşiklerini yapılandırın.
- Hazırlama, dizileme ve demultipleksleme süreçlerinin tamamında numuneleri tam izlenebilirlikle takip edin.
- Kalite kontrolleri ve temel göstergeler dahil olmak üzere tam denetimden geçmiş sonuçları inceleyin; yetkilendirin veya yeniden değerlendirmeye yönlendirin.
- Her kullanıcının yalnızca gerekli bilgilere erişebilmesi için rollere göre izinler atayın.
- Birden fazla merkezdeki sekanslama işlemlerini tek bir kontrol panelinde merkezileştirmek.
- Bulut üzerinden her yerden erişin veya kendi güvenli sunucunuza kurun
Yardıma mı ihtiyacınız var?
Sıkça Sorulan Sorular
LIMS, genomik laboratuvarın uygulanabilir ISO/IEC 17025 veya ISO 15189 kapsamını nasıl destekler?
Genomik LIMS; yapılandırılmış denetim kayıtları, elektronik imzalar, cihaz kalibrasyonu ve metrolojik izlenebilirlik kayıtları, yöntem validasyonu veya doğrulaması ve kalite iş akışlarıyla geçerli ISO/IEC 17025 veya ISO 15189 gerekliliklerini destekleyebilir. Numune emanet zinciri ile metrolojik izlenebilirlik kayıtları ayrı tutulur ve dokümantasyon kapsamı laboratuvar tarafından tanımlanır.
Sistem birden fazla sekanslama platformu ve cihazını destekliyor mu?
Evet. Illumina platformları (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), Oxford Nanopore sistemleri ve Bioanalyzer, TapeStation, qPCR sistemleri ile Qubit gibi yaygın kalite kontrol cihazlarıyla entegrasyonu destekliyoruz. Sistem, sahip olduğunuz cihaz parkına ve iş akışı gereksinimlerinize göre yapılandırılabilir.
LIMS, çoklu analizlerde indeks çakışmalarını nasıl önler?
Sistem, havuzlanmış kütüphaneler oluşturulurken indeks uyumluluğunu seçilen indeks seti ve dizileme kimyasına göre kontrol edebilir. Olası çakışmalar tanımlı QC incelemesine yönlendirilir; çift indeks kombinasyonları ve doğrulama kuralları laboratuvarın protokol sürümüne göre yapılandırılır.
Özel sekanslama protokollerimiz için iş akışlarını özelleştirebilir miyiz?
Evet. XRF, ICP, AAS, füzyon cihazları ve daha fazlasıyla entegrasyonu destekliyoruz. Raporları ve sonuçları manuel biçimlendirme gerektirmeden diğer yazılım veya ERP platformlarına aktarabilirsiniz. Kesinlikle. Odoo’nun esnek altyapısı üzerine kurulu olan sistemde, laboratuvarınızın özel süreçlerine uyacak şekilde kütüphane hazırlama protokollerini, kalite kontrol kontrol noktalarını, sekanslama çalıştırma parametrelerini ve onay iş akışlarını yapılandırabilirsiniz. Uygulama sürecinde sizinle birlikte çalışarak sistemi ihtiyaçlarınıza göre uyarlayacağız.
Hangi numune türleri ve sekanslama uygulamaları desteklenmektedir?
Sistem, çeşitli numune türlerini (doku, kan, tükürük, çevresel numuneler) ve tam genom dizileme (WGS), tam ekzom dizileme (WES), RNA-seq, hedefli paneller, metagenomik ve tek hücre dizileme gibi dizileme uygulamalarını desteklemektedir. İş akışları, araştırma, klinik ve ticari dizileme işlemleri için özelleştirilebilir.
Verilerin demultiplekslenmesi işlemi LIMS'e nasıl aktarılır?
Demultipleksleme sonuçlarını CSV dosyası yükleyerek içe aktarabilir veya doğrudan biyoinformatik iş akışınızla entegre edebilirsiniz. Sistem, demultiplekslenmiş numuneleri kaynak kütüphanelerine ve sekanslama çalışmasına geri bağlayarak, numunenin teslim alınmasından nihai verilerin teslimine kadar tam bir izlenebilirlik sağlar.
Sekanslama operasyonlarınızı LIMS ile yönetin
Numune kabulünden veri teslimine kadar NGS durumlarını, rolleri, QC kapılarını, cihaz bağlarını ve istisna yollarını LIMS'te nasıl yapılandıracağınızı kişiselleştirilmiş demoda inceleyin.