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LIMS genomico per laboratori NGS

Gestione della complessità dai campioni ai dati di sequenziamento. Monitoraggio della preparazione delle librerie, delle operazioni di sequenziamento e dei flussi di lavoro di demultiplexing con tracciabilità completa.
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Gestione completa del flusso di lavoro NGS in un unico sistema

Interfaccia di sequenziamento che mostra i parametri di NovaSeq 6000 e le metriche QC a livello di corsia
Traccia i parametri di sequenziamento, i dettagli degli strumenti e le metriche di prestazione per corsia.
Risultati di demultiplexing che mostrano rese dei campioni, punteggi Q30 e stato approvato/respinto tra le run
Monitora i risultati di demultiplexing con metriche di resa e qualità a livello di campione.
Interfaccia set di indici che mostra IDT90 con 96 sequenze di indici duali e le loro proprietà
Gestisci le librerie di indici e previeni conflitti con tracciamento completo delle sequenze.

Progettato per la complessità della genomica

Capacità di integrazione

Sistemi Illumina NovaSeq
Piattaforme Illumina NextSeq
Strumenti Illumina MiSeq
Oxford Nanopore MinION
Oxford Nanopore PromethION
Sistemi di quantificazione qPCR
Integrazione Bioanalyzer
Importazione dati TapeStation
Risultati Fragment Analyzer
Misurazioni fluorimetro Qubit
Lettori di piastre
Termociclatori
Pipeline LIMS-bioinformatica
Generazione fogli campione
Importazione CSV demux automatizzata
Integrazione BaseSpace
Connessioni API personalizzate
Sistemi di automazione di laboratorio
Scanner di codici a barre

Entità genomiche fondamentali

Campioni e tipi di campioni
Estrazione di DNA/RNA
Preparazione delle librerie
Misurazioni QC delle librerie
Assegnazione degli indici
Librerie aggregate
Quantificazione delle aggregazioni
Esecuzioni di sequenziamento
Assegnazione delle corsie
Strutture di lettura
Campioni demultiplexati
Tracciamento dei file Fastq
Esecuzioni della pipeline di analisi
Punti di controllo della qualità
Progetti e studi
Risultati finali per i clienti
Tracciamento dei lotti di reagenti
Set di indici e codici a barre
Strumenti di sequenziamento
Luoghi di conservazione

Conformità e tracciabilità

Conformità ISO 17025 e ISO 15189
Audit trail completi
Tracciabilità della catena di custodia
Tracciabilità dei campioni
Controllo delle versioni
Controlli di accesso
Autorizzazioni per ruolo
Firme elettroniche (ALCOA+)
Registri di taratura
Registri di manutenzione
Validazione dei metodi
Procedure operative (SOP)
Gestione qualità integrata
Tracciabilità delle non conformità
Azioni correttive e preventive (CAPA)
Reportistica per audit
Integrità e sicurezza dei dati
Gestione lotti e reagenti
Gestione documentale
Registri di formazione del personale

Caratteristiche principali per laboratori NGS

Funzionalità appositamente progettate per affrontare la complessità unica dei flussi di lavoro genomici, dalla prevenzione dei conflitti di indice alla garanzia della conformità normativa.

Tracciabilità completa dei campioni

Traccia l’intero percorso del campione, dalla libreria al pooling, al sequenziamento e alla consegna dei dati.

Prevenire costosi conflitti di indici

La convalida integrata rileva collisioni di indici prima del pooling, evitando errori e sequenze costose fallite.

Integrazione diretta degli strumenti

Elimina l’inserimento manuale grazie all’integrazione con Illumina, Oxford Nanopore e strumenti QC come Bioanalyzer, qPCR e TapeStation.

Generazione automatica dei fogli campione

Genera fogli campione convalidati e privi di errori, con indici, corsie e parametri di esecuzione corretti.

Gestione centralizzata del controllo qualità

Consolida i controlli qualità di libreria, pool ed esecuzione in un unico sistema con criteri configurabili.

Conformità alle norme ISO 17025/15189

Audit trail integrati, firme elettroniche e documentazione completa soddisfano i requisiti normativi senza costi aggiuntivi.

Odoo

Sistema di gestione del laboratorio di genomica basato su Odoo

LIMS.SCIENCE funziona interamente su Odoo, un potente sistema ERP utilizzato da oltre 15 milioni di utenti in tutto il mondo.

Lo abbiamo adattato specificamente per i laboratori di sequenziamento di nuova generazione. È possibile gestire tutto, dal tracciamento dei campioni e la preparazione delle librerie alle operazioni di sequenziamento, demultiplexing e conformità in un unico posto.

  • Configura protocolli, set di indici e soglie QC per i tuoi flussi NGS.
  • Traccia i campioni dalla libreria al pooling, al sequenziamento e al demultiplexing con tracciabilità completa.
  • Approva o rifiuta i risultati con audit trail completi, includendo QC, convalida dell’esecuzione e flag di qualità.
  • Assegna l’accesso in base al ruolo, così tecnici, bioinformatici, QA e clienti vedono solo ciò che serve.
  • Centralizza le operazioni di sequenziamento multisito in un’unica dashboard per ricerca, clinica e servizi.
  • Accedi ovunque tramite il cloud o installa sul tuo server sicuro

Hai bisogno di aiuto?

Domande frequenti

Sì. Il nostro LIMS genomico è progettato per supportare la conformità alla norma ISO 17025 con audit trail completi, firme elettroniche, tracciabilità della calibrazione degli strumenti, documentazione di convalida dei metodi e flussi di lavoro per la gestione della qualità. Il sistema conserva i registri della catena di custodia e fornisce la struttura documentale necessaria per gli audit normativi.

Sì. Supportiamo l’integrazione con le piattaforme Illumina (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), i sistemi Oxford Nanopore e gli strumenti di controllo qualità più comuni, tra cui Bioanalyzer, TapeStation, sistemi qPCR e Qubit. Il sistema può essere configurato in base alle specifiche esigenze della vostra flotta di strumenti e del vostro flusso di lavoro.

Il sistema verifica la compatibilità degli indici durante la creazione di librerie condivise, controllando eventuali conflitti in base ai set di indici e alla chimica di sequenziamento. È possibile gestire librerie complete di combinazioni con doppio indice grazie alla convalida automatica, proteggendo così costose operazioni di sequenziamento da errori dovuti a conflitti tra indici.
Sì. Supportiamo l’integrazione con XRF, ICP, AAS, strumenti di fusione e altro ancora. È inoltre possibile esportare report e risultati su altri software o piattaforme ERP senza formattazione manuale. Assolutamente sì. Basato sul framework flessibile di Odoo, è possibile configurare protocolli di preparazione delle librerie, punti di controllo QC, parametri di sequenziamento e flussi di lavoro di approvazione in modo da adattarli ai processi specifici del proprio laboratorio. Collaboriamo con voi durante l’implementazione per adattare il sistema alle vostre esigenze.
Il sistema gestisce diversi tipi di campioni (tessuti, sangue, saliva, campioni ambientali) e applicazioni di sequenziamento, tra cui sequenziamento dell’intero genoma (WGS), sequenziamento dell’intero esoma (WES), RNA-seq, pannelli mirati, metagenomica e sequenziamento di singole cellule. I flussi di lavoro sono personalizzabili per operazioni di sequenziamento a fini di ricerca, clinici e commerciali.
È possibile importare i risultati del demultiplexing tramite caricamento CSV o integrarli direttamente nella propria pipeline bioinformatica. Il sistema ricollega i campioni demultiplexati alle loro librerie di origine e alle sequenze di sequenziamento, mantenendo la completa tracciabilità dal ricevimento del campione alla consegna dei dati finali.

Gestisci il tuo sequenziamento con un LIMS dedicato

Scoprite come un LIMS dedicato può semplificare i vostri flussi NGS, dal campione alla consegna dei dati. Richiedete una demo personalizzata.

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