LIMS pour laboratoires de génomique NGS

Gérer la complexité, de l’échantillon aux données de séquençage. Suivez la préparation des bibliothèques, les cycles de séquençage et les workflows de démultiplexage avec une traçabilité totale.

Gestion complète du flux de travail NGS dans un seul système

Conçu pour la complexité génomique

Entités génomiques fondamentales

Échantillons et types de spécimens
Extractions d’ADN/ARN
Préparation des bibliothèques
Mesures de contrôle qualité des bibliothèques
Attributions d’index
Bibliothèques regroupées
Quantification des regroupements
Séquençages
Attributions de voies
Structures de lecture
Échantillons démultiplexés
Suivi des fichiers Fastq
Exécution des pipelines d’analyse
Points de contrôle qualité
Projets et études
Livrables clients
Suivi des lots de réactifs
Ensembles d’index et codes-barres
Instruments de séquençage
Emplacements de stockage

Capacités d’intégration

Systèmes Illumina NovaSeq
Plateformes Illumina NextSeq
Instruments Illumina MiSeq
Oxford Nanopore MinION
Oxford Nanopore PromethION
Systèmes de quantification qPCR
Intégration Bioanalyzer
Importation de données TapeStation
Résultats Fragment Analyzer
Mesures fluorimétriques Qubit
Lecteurs de plaques
Thermocycleurs
Pipelines LIMS vers bio-informatique
Génération de feuilles d’échantillons
Importation CSV démultiplexée automatisée
Intégration BaseSpace
Connexions API personnalisées
Systèmes d’automatisation de laboratoire
Scanners de codes-barres

Conformité et traçabilité

Conformité à la norme ISO 17025
Support accréditation COFRAC (France)
Support accréditation SCC (Canada)
Support accréditation BELAC (Belgique)
Support accréditation SAS (Suisse)
Pistes d’audit complètes
Suivi de la chaîne de contrôle
Suivi de la provenance des échantillons
Contrôle des versions
Contrôles d’accès des utilisateurs
Autorisations basées sur les rôles
Signatures électroniques
Registres d’étalonnage des instruments
Journaux de maintenance des équipements
Documentation de validation des méthodes
Procédures opérationnelles standard
Intégration de la gestion de la qualité
Suivi des non-conformités
Registres des mesures correctives
Rapports réglementaires
Contrôles de l’intégrité des données
Gestion des documents
Registres de formation

Caractéristiques clés pour laboratoires NGS

Des fonctionnalités spécialement conçues pour répondre à la complexité unique des flux de travail génomiques, de la prévention des conflits d'indexation à la garantie de la conformité réglementaire.

Traçabilité complète des échantillons

Suivez tout le parcours de l’échantillon, de la préparation de la bibliothèque au regroupement, au séquençage et à la livraison des données.

Évitez les conflits d'index coûteux

La validation intégrée détecte les collisions d'index potentielles avant la création du pool, protégeant ainsi les séquences coûteuses contre les échecs.

Intégration directe des instruments

Éliminez la saisie manuelle grâce à l’intégration avec Illumina, Oxford Nanopore et les instruments QC comme Bioanalyzer, qPCR et TapeStation.

Génération automatisée de fiches d'échantillons

Générez des feuilles d’échantillons validées et fiables, avec index, voies et paramètres d’exécution corrects.

Gestion centralisée du contrôle qualité

Consolidez tous les points de contrôle qualité, de la bibliothèque au pool puis aux mesures d’exécution, avec des critères de réussite ou d’échec configurables.

Conforme aux normes ISO 17025/15189

Les pistes d’audit, signatures électroniques et documents complets répondent aux exigences réglementaires sans coût supplémentaire.

Système de gestion de laboratoire de génomique basé sur Odoo

LIMS.SCIENCE fonctionne entièrement sur Odoo, un puissant système ERP qui a gagné la confiance de plus de 15 millions d'utilisateurs à travers le monde.

Nous l'avons spécialement adapté aux laboratoires de séquençage de nouvelle génération. Vous pouvez tout gérer depuis un seul endroit, du suivi des échantillons et la préparation des bibliothèques aux séquences, au démultiplexage et à la conformité.

Configurez protocoles, ensembles d’index et seuils QC pour vos flux NGS.
Suivez les échantillons de la bibliothèque au regroupement, au séquençage et au démultiplexage avec une traçabilité complète.
Approuvez ou rejetez les résultats avec pistes d’audit, QC, validation et indicateurs de qualité.
Attribuez des droits d’accès par rôle pour que techniciens, bioinformaticiens, QC et clients ne voient que l’essentiel.
Centralisez les opérations de séquençage multisites, recherche, clinique et services, dans un seul tableau de bord.
Accédez-y où que vous soyez via le cloud ou installez-le sur votre propre serveur sécurisé.

Besoin d'aide ?

Foire aux questions

Ce LIMS est-il conforme à la norme ISO 17025 pour les laboratoires de séquençage clinique ?

Oui. Notre LIMS génomique est conçu pour prendre en charge la conformité à la norme ISO 17025 grâce à des pistes d’audit complètes, des signatures électroniques, le suivi de l’étalonnage des instruments, la documentation de validation des méthodes et les workflows de gestion de la qualité. Le système conserve les enregistrements de la chaîne de contrôle et fournit la structure de documentation nécessaire aux audits réglementaires.

Le système peut-il prendre en charge plusieurs plateformes et instruments de séquençage ?

Oui. Nous prenons en charge l’intégration avec les plateformes Illumina (NovaSeq, NextSeq, MiSeq), les systèmes Oxford Nanopore et les instruments de contrôle qualité courants, notamment Bioanalyzer, TapeStation, les systèmes qPCR et Qubit. Le système peut être configuré en fonction de votre parc d’instruments et de vos exigences en matière de flux de travail.

Comment le LIMS empêche-t-il les conflits d'index dans les analyses multiplexées ?

Le système valide la compatibilité des index lors de la création de bibliothèques mutualisées, en vérifiant les conflits potentiels en fonction de vos ensembles d’index et de la chimie de séquençage. Vous pouvez gérer des bibliothèques complètes de combinaisons à double indexation avec validation automatique afin de protéger les séquençages coûteux contre les échecs liés aux conflits d’index.

Pouvons-nous personnaliser les flux de travail pour nos protocoles de séquençage spécifiques ?

Oui. Nous prenons en charge l’intégration avec les instruments XRF, ICP, AAS, de fusion et bien d’autres encore. Vous pouvez également exporter des rapports et des résultats vers d’autres logiciels ou plateformes ERP sans formatage manuel. Absolument. Grâce à la flexibilité du framework Odoo, vous pouvez configurer des protocoles de préparation de bibliothèques, des points de contrôle qualité, des paramètres d’exécution de séquençage et des workflows d’approbation afin de les adapter aux processus spécifiques de votre laboratoire. Nous travaillons avec vous pendant la mise en œuvre afin d’adapter le système à vos besoins.

Quels types d'échantillons et quelles applications de séquençage sont pris en charge ?

Le système prend en charge divers types d’échantillons (tissus, sang, salive, échantillons environnementaux) et applications de séquençage, notamment le séquençage du génome entier (WGS), le séquençage de l’exome entier (WES), le séquençage d’ARN, les panels ciblés, la métagénomique et le séquençage unicellulaire. Les flux de travail sont personnalisables pour les opérations de séquençage à des fins de recherche, cliniques et commerciales.

Comment les données démultiplexées sont-elles intégrées dans le LIMS ?

Vous pouvez importer les résultats du démultiplexage via un téléchargement CSV ou les intégrer directement à votre pipeline bioinformatique. Le système relie les échantillons démultiplexés à leurs bibliothèques sources et à leurs séquences, garantissant ainsi une traçabilité complète depuis la réception des échantillons jusqu’à la livraison finale des données.

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